叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
缪序卷一一、卒尸二、痹三、？（痉）四、痿五、厥六、伤寒六经余证七、大头肿痛（附:蛤蟆瘟）蛤蟆瘟八、霍乱九、瘟病十、伤暑十一、疟十二、疸十三、劳（劳极 烦热 劳瘵）劳极烦热劳瘵卷二十四、热十五、吐衄下血
玉石部上品丹砂玉泉玉屑云母石钟乳朴硝芒硝硝石玄明粉生硝矾石滑石空青曾青石胆绿青赤石脂白石脂青石脂黑石脂黄石脂白石英紫石英禹余粮太一余粮无名异绿矾柳絮矾婆娑石中品雄黄石硫黄雌黄食盐水银石膏金屑银屑生银灵
序卷之一诸中门中风中气中寒中暑中湿中恶厥卷之二诸伤门伤风寒伤暑伤湿伤酒伤食伤食泻卷之三诸气门七气痞塞积聚肿蛊胀香港脚阴气手气小肠气卷之四诸血门鼻衄舌衄肌衄牙宣吐血咯血嗽血小便血破伤血（见疮毒 扑证）大
七十二症辨治方法
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
洄溪医案
卷一月经前期论（一）月经后期论（二）月经或前或后（三）卷二脉法辨孕男女脉法歌调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘胎衣不下产后寒热产后血晕产后腹痛阴户脱卷三调经种子崩漏论赤白带
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
金匮要略方论序卷上藏府经络先后病脉证第一痉湿喝病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病