序卷一总赋寒性热性温性平性用药发明标本论用药法药性升降浮沉补泻法五脏所欲五脏所苦五气凑五脏例五行五色五味走五脏主禁例手足三阳表里引经主治例诸药泻诸经之火邪诸药相反例十八反歌十九畏歌六陈歌五脏补泻主治例
自序卷上 辨证瘴疟形状人身肖天地瘴疟类天时受病之源瘴疟伤寒辨瘴疟内伤辨诸疟瘴疟辨伤寒瘴疟分南北辨瘴疟五脏俱病冷瘴热瘴瘴不治症脉日期妇人小儿发瘴时调理却病法瘴病中将息法瘴病后将息法灸法瘴后变症痢肿胀痰治
一、发散解表紫苏粥葱白粥干葛粥生姜粥葱豉粥神仙粥发汗鼓粥姜苏饮姜糖葱白饮银花簿荷饮菜根红糖饮罗汉果饮葱豉汤香薷饮桑叶菊花饮蜜糖银花露杭菊糖茶二、化痰止咳江米粥牛蒡粥阿胶粥杏仁蒸肉白果鸡丁玉参焖鸭虫草鹌
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
药性歌括四百味
序卷一水火天雨水立春节雨水梅雨水液雨水腊雪水冰露水半天河水屋漏水冬霜冰雹水方诸水千里水井水节气水山岩泉水乳穴水温泉海水古冢中水磨刀水地浆浆水齑水甑气水熟汤生熟汤诸水有毒燧火桑柴火灶下灰火艾火卷二谷类粳
医略
验方徐果亭先生试验神方送蛋药酒方（男人服）种子红药连城丸老奴丸（一名苍龙丸）又种子奇方种子金丸种子金丸如意线方长龟方（一）秘传壮阳固精酒奇妙方涤痿兴阳汤安息香闻香起马方治腰痛神方补腰益肾壮元阳补血气圣