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卷一针道源流针灸直指针灸方宜始论刺热论刺疟论刺咳论刺腰痛论奇病论刺要论刺齐论刺志论长刺节论皮部论经络论骨空论刺水热穴论调经论缪刺论经刺论巨刺论手足阴阳流注论卫气行论诊要经终论刺禁论刺法论五刺应五脏论：
周选堂（着）序一：李序序二：章序序三：徐序编者的话卷一 冬伤于寒春必病温大意一、概述二、分述（一）春温（二）风温（三）温病（四）温毒（五）晚发选按三、拟用诸法（一）辛温解表法（二）凉解里热法（三）清热
序序卷第一经络图卷第二脉穴图卷第三卷第四卷第五卷第六卷第七卷第八卷第九卷第十卷第十一卷第十二卷第十三卷第十四卷第十五卷第十六卷第十七卷第十八卷第十九卷第二十卷第二十一卷第二十二 伤寒十劝
卷上痘疹发微惊风卷中论望色论芤脉论人参论犀角杂记卷下三疟治验神水治验制神水秘法妇科验方
序例脉法总括汪 庵先生秘本 清御医吴谦审定卷一中风部一风寒部二温热部三感冒部四瘟疫部五伤暑部六瘫痪部七痿部八风湿身痛部九如风湿部十厥部十一脾胃部十二酒部十三痰饮部十四咳嗽部十五肺痿部十六喘部十七疟部十
书《玉机微义》后序兰室集·医家十要兰室誓戒戒行吟调鼎吟风火暑湿燥寒发热腹痛头痛腰痛胁痛心痛牙疼眼目泻痢疟（又名）咳嗽吐衄血溺血下血诸气漏淋小水不禁（详淋）喉痹诸疮漏疮疥风癣痔疮疮疝香港脚转筋痿内伤痰饮
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
序一序二序三例言卷上疡证总论疡科调治心法略义申明外疡实从内出论辨脑疽对口论脑疽后论辨百会疽玉枕疽论辨夭疽锐毒虚实论辨大头瘟抱头火丹毒论辨鬓疽额疽论辨凤眉疽眉心疔眉发论辨眼丹眼漏论辨眼胞菌毒眼胞痰核论辨
卷一九针十二原第一（法天）本输第二（法地）小针解第三（法人）邪气脏腑病形第四（法时）卷二根结第五（法音）寿夭刚柔第六（法律）官针第七（法星）本神第八（法风）终始第九（法野）卷三经脉第十经别第十一经水第